Предприятие было учреждено Постановлением администрации г. Бийска № 1200 от 11.11.1997г.

Оно возникло под наименованием: организация городская контора «Водоканал» 4 мая 1957 года. Начинали работать с применением примитивных орудий труда: ведро, грабли. Из транспортных средств была одна машина ЗИС-5 и одна лошадь с телегой и санями. Водопроводная сеть была крохотной, действовало 22 колонки и две водоразборные будки по переулку Партизанскому и ул. Двойных, где воду отпускали по 1 копейке, деньги собирали прямо на месте. При сильных морозах отогрев колонок производили горячей водой, которую брали в бане и в бочках доставляли к месту на лошади и санях. Позднее было введено новшество: на автомашине ЗИС – 5 было установлено оборудование и отогрев колонок производили паром.

С тех пор было осуществлено несколько очередей строительства объектов водоснабжения. В 1960 году был проложен один дюкер Д-300мм через р.Бия и вода подавалась с острова в город через дюкер. Работала одна скважина № 4. Управление насосами было ручное. На первой стадии реализация воды осуществлялась через водопроводные колонки, расположенные преимущественно в домах одноэтажной застройки центральной и нагорной части города. Особенно интенсивное развитие мелких сетей и колонок шло до 1970 года, около100 кмсетей и 180 колонок.

В 70 – х годах были проложены второй и третий дюкера через реку Бия Д-400 мми Д-600 мм. По мере застройки центра города многоэтажными домами количество колонок и мелких сетей стало уменьшаться. Новое более крупное развитие получило водоснабжение после ввода в строй второй очереди, производительность которой до 50,0 тыс. м3 в сутки. Кроме того вступили в строй крупные сооружения : станции 2-го и 3-го подъема, крупное энергетическое хозяйство. С 1997 года Водоканал» принял много сетей и объектов, перешедших из ведомственного подчинения в муниципальную собственность.

Услуги водоотведения Водоканал стал осуществлять с 1967 года, после приемки канализационно – очистных сооружений от ЖКО «Химкомбината». Технологический цикл был примитивным, все операции производились вручную. Необходимо было в корне перестроить производственный процесс.

В 1968-1969 годы началось строительство вторичных отстойников, хлораторной с использованием жидкого хлора и других объектов, необходимых для пропуска сточных вод до 40-50 тыс.м3 в сутки.

За период с 1997 года по 2008 год было принято на баланс МУП г. Бийска «Водоканал»143,8 кмводопроводных и 155,8 кмканализационных сетей; водозаборы: №2, пос. Молодежный, Нефтебазы, Новый, Фоминское, Одинцово, Жаворонки, Мало-Угренева, Нагорный, Водозабор и   очистные сооружения пос. Сорокино. На момент передачи все вышеперечисленные объекты находились в плачевном состоянии:  на скважинах  водозаборов требовалась замена насосного оборудования, промывка и ремонт водонапорных башен; ремонт и многократная промывка водопроводных сетей, так как анализы питьевой воды не соответствовали требованиям СанПиНа. Очистные сооружения пос. Сорокино практически не работали: отсутствовали воздуходувки соответственно не работали аэротенки, т. е. не проводилась биологическая очистка стоков. Всё это было восстановлено и запущено в работу в кратчайшее время.

Ежегодно проводится плановая замена насосного оборудования скважин. Были проложены новые водопроводные сети по пер. Телецкий, Веселый, Текстильный, Шатского, Третьяка, Донскому, ул. Севастопольская, Граничная. Выполнены закольцовки водопровода и подключены к городскому водопроводу пос. Химик, Строителей, Сахарного завода, Льнокомбината, квартала АБ, что позволяет бесперебойно и в достаточном количестве снабжать жителей города качественной питьевой водой.  Ежегодно проводится замена 3-4 км водопроводных сетей, что позволило сократить число аварий  на сетях водопровода до 2 ед на 10км сетей, когда в среднем по РФ данный показатель составляет 8 ед.

На очистных сооружениях города проведены большие работы по улучшению качества сбрасываемой воды в реку Бия; заменены решетки, построены две песколовки, вторичный отстойник, проведена замена аэрационных труб на аэротенках, капитально отремонтированы первичные и вторичные отстойники с заменой отводящих коллекторов Д-800 мм протяженностью 100 м.

Для контроля качества питьевой воды регулярно проводится отбор проб воды лабораториями МУП г Бийска «Водоканал» и ТО «Роспотребнадзора». Результаты бак. и хим. анализов Водозабора №1, основного поставщика питьевой воды для населения города, соответствуют требованиям СанПиН 2.1.4-1074-01 «Питьевая вода. Контроль качества…».

В апреле 2011 года на баланс предприятия принята станция обезвоживания и утилизации сырого осадка на городских КОС. Осадки влажностью 99,7%, образующиеся при очистке сточных вод, обезвоживаются, с помощью современной компактной и высокопроизводительной техники декантирующих центрифуг фирмы “Флотвег”, до 65% влажности. Обезвоженный осадок – кек – утилизируется на полигоне ТБО, что позволило уйти от эксплуатации иловых полей и затрат на наращивание дамбы. Тем самым решена проблема по экологической безопасности не только нашего города, но и районов, расположенных ниже по течению реки Обь.

В декабре 2011 года принята на баланс предприятия станция обезжелезивания Водозабора №2, что улучшает показатели качества питьевой воды, повышает уровень санитарно-эпидемиологического благополучия 18 000 человек населения города Бийска, пользующихся питьевой водой Водозабора № 2, а именно района квартала «АБ», пос. «Полиэкс», микрорайона «Строитель». Благодаря строительству станции обезжелезивания на Водозаборе №2 удалось добиться следующих показателей:

В декабре 2011 года на баланс предприятия принята станция обезжелезивания на Водозаборе №3, которая улучшает показатели качества питьевой воды, повышает уровень санитарно-эпидемиологического благополучия 9 000 человек населения пос. Сорокино, Молодежное. Благодаря строительству станции обезжелезивания на Водозаборе №3 удалось добиться следующих показателей: